為落實(shí)水生態(tài)環(huán)境保護(hù)網(wǎng)格化管理制度，我市積極開展重要生態(tài)保護(hù)區(qū)、水源涵養(yǎng)區(qū)等建設(shè)。同時(shí)，我市全面建立以黨政首長(zhǎng)負(fù)責(zé)制為核心的河（湖）長(zhǎng)制工作機(jī)制、考核機(jī)制和獎(jiǎng)懲機(jī)制，落實(shí)以保護(hù)水資源、防治水污染、改善水環(huán)境、修復(fù)水生態(tài)為主要任務(wù)的河道管理與保護(hù)責(zé)任，率先提出河長(zhǎng)制、湖長(zhǎng)制、斷面長(zhǎng)制“三長(zhǎng)一體”同步實(shí)施機(jī)制，首創(chuàng)“一河長(zhǎng)兩助理”協(xié)調(diào)推進(jìn)機(jī)制，創(chuàng)新實(shí)行“雙總河長(zhǎng)”領(lǐng)導(dǎo)機(jī)制，探索實(shí)踐骨干河道綜合治理與鄉(xiāng)村河道管護(hù)“五位一體”深度融合機(jī)制等，全力打造河（湖）長(zhǎng)制的“淮安模式”。

我市創(chuàng)新引入生態(tài)補(bǔ)償理念，設(shè)立縣區(qū)水質(zhì)交界斷面，實(shí)行生態(tài)補(bǔ)償機(jī)制，并全面加強(qiáng)濕地保護(hù)，促進(jìn)河流、湖泊生態(tài)系統(tǒng)的自然恢復(fù)，全面形成人水和諧、河湖健康的水生態(tài)保護(hù)體系。我市創(chuàng)成國(guó)家水生態(tài)文明城市，全面落實(shí)最嚴(yán)格水資源管理制度，強(qiáng)化“三條紅線”管控，基本形成覆蓋全市的水資源、水環(huán)境和水生態(tài)監(jiān)測(cè)、評(píng)價(jià)、管理和服務(wù)體系。目前，全市主要河湖生物多樣性和健康指數(shù)呈良好發(fā)展態(tài)勢(shì)。